Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK5Q6P3R8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK5Q6P3R8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK5Q6P3R8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms