Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H3F3CQ6NXT2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3F3CQ6NXT2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3F3CQ6NXT2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms