Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RWDD4Q6NW29 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RWDD4Q6NW29 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms