Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTL6Q6ICC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL6Q6ICC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL6Q6ICC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms