Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV0

FOXB2, Forkhead box protein B2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB2Q5VYV0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXB2Q5VYV0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXB2Q5VYV0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXB2Q5VYV0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXB2Q5VYV0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXB2Q5VYV0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXB2Q5VYV0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXB2Q5VYV0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms