Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms