Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HECTD3Q5T447 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HECTD3Q5T447 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HECTD3Q5T447 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HECTD3Q5T447 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms