Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARCH8Q5T0T0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARCH8Q5T0T0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MARCH8Q5T0T0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARCH8Q5T0T0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MARCH8Q5T0T0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MARCH8Q5T0T0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MARCH8Q5T0T0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MARCH8Q5T0T0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MARCH8Q5T0T0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MARCH8Q5T0T0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCH8Q5T0T0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCH8Q5T0T0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms