Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRAMEF14Q5SWL7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF14Q5SWL7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF14Q5SWL7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF14Q5SWL7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms