Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITRM1Q5JRX3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITRM1Q5JRX3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITRM1Q5JRX3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms