Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF542PQ5EBM4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF542PQ5EBM4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF542PQ5EBM4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF542PQ5EBM4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms