Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HS1BP3Q53T59 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HS1BP3Q53T59 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HS1BP3Q53T59 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HS1BP3Q53T59 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HS1BP3Q53T59 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HS1BP3Q53T59 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HS1BP3Q53T59 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HS1BP3Q53T59 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HS1BP3Q53T59 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
HS1BP3Q53T59 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HS1BP3Q53T59 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HS1BP3Q53T59 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms