Protein–RNA interactions for Protein: Q53FP2

TMEM35A, Transmembrane protein 35A, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35AQ53FP2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35AQ53FP2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35AQ53FP2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35AQ53FP2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35AQ53FP2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35AQ53FP2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM35AQ53FP2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM35AQ53FP2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM35AQ53FP2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM35AQ53FP2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms