Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC39A12Q504Y0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A12Q504Y0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC39A12Q504Y0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC39A12Q504Y0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC39A12Q504Y0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 437 ms