Protein–RNA interactions for Protein: Q4G176

ACSF3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF3Q4G176 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACSF3Q4G176 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSF3Q4G176 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSF3Q4G176 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms