Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MINDY4Q4G0A6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MINDY4Q4G0A6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MINDY4Q4G0A6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms