Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CERKLQ49MI3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CERKLQ49MI3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CERKLQ49MI3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CERKLQ49MI3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms