Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC4A8Q2Y0W8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A8Q2Y0W8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A8Q2Y0W8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A8Q2Y0W8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms