Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIR3

EIF2S3L, Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF2S3LQ2VIR3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF2S3LQ2VIR3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EIF2S3LQ2VIR3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EIF2S3LQ2VIR3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms