Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM71Q2Q1W2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM71Q2Q1W2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM71Q2Q1W2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM71Q2Q1W2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms