Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTGISQ16647 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGISQ16647 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGISQ16647 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGISQ16647 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGISQ16647 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms