Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 TULP4-207ENST00000620026 680 ntTSL 416.59■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-216ENST00000444012 605 ntTSL 415.35■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-225ENST00000471533 329 ntTSL 315.31■□□□□ 0.043e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 314.95□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SNHG17-207ENST00000449469 2138 ntTSL 214.65□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 AKT1-204ENST00000544168 1564 ntTSL 214.56□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-211ENST00000423749 771 ntTSL 514.3□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 TUBGCP6-208ENST00000498611 5274 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 514.25□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 513.92□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-212ENST00000428692 541 ntTSL 413.92□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 CYP4F12-205ENST00000518629 1915 ntTSL 213.65□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 213.62□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 TUBGCP6-203ENST00000434349 830 ntTSL 513.31□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.323e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 RPH3AL-216ENST00000575130 579 ntTSL 412.82□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 CYP4F12-216ENST00000550627 2264 ntTSL 211.99□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SNHG17-202ENST00000414142 2102 ntTSL 211.63□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-214ENST00000439084 584 ntTSL 311.36□□□□□ -0.593e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SHANK2-214ENST00000468619 2775 ntTSL 211.22□□□□□ -0.615e-8■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 411□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.683e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-226ENST00000471601 1730 ntTSL 210.7□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 FOXN2-202ENST00000413569 932 ntTSL 310.65□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.723e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SHANK2-217ENST00000498519 510 ntTSL 310.55□□□□□ -0.725e-8■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.783e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 AKT1-212ENST00000555380 534 ntTSL 49.6□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 CYP4F12-204ENST00000517734 2860 ntTSL 29.39□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.923e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.931e-11■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.931e-11■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-206ENST00000409385 2320 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.993e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.011e-11■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.011e-11■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SOX5-204ENST00000441133 638 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.026e-7■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 CYP4F12-206ENST00000546608 3256 ntTSL 28.49□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.066e-7■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.091e-11■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-219ENST00000453663 637 ntTSL 47.74□□□□□ -1.173e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-207ENST00000409397 920 ntTSL 37.57□□□□□ -1.23e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.283e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.336e-7■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.373e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SOX5-201ENST00000367206 1816 ntTSL 25.68□□□□□ -1.56e-7■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 SPATS2L-215ENST00000439395 561 ntTSL 45.31□□□□□ -1.563e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.643e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.673e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.673e-6■■■■□ 20.3
SRSF7Q16629 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.722e-7■■■■□ 20.2
SRSF7Q16629 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 20.2
SRSF7Q16629 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-7■■■■□ 20.2
SRSF7Q16629 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 20.2
SRSF7Q16629 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 514.85□□□□□ -0.032e-7■■■■□ 20.2
SRSF7Q16629 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 514.35□□□□□ -0.112e-7■■■■□ 20.2
SRSF7Q16629 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 20.2
SRSF7Q16629 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.92e-7■■■■□ 20.2
SRSF7Q16629 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.692e-7■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-7■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.052e-7■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.354e-9■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.354e-9■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SLC38A5-205ENST00000441948 871 ntTSL 511.8□□□□□ -0.524e-9■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SLC38A5-209ENST00000497336 493 ntTSL 511.8□□□□□ -0.524e-9■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.534e-9■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.64e-9■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SLC38A5-204ENST00000440085 910 ntTSL 310.92□□□□□ -0.664e-9■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SLC38A5-202ENST00000416711 708 ntTSL 510.75□□□□□ -0.694e-9■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SLC38A5-201ENST00000413668 741 ntTSL 29.72□□□□□ -0.854e-9■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SLC38A5-208ENST00000494034 525 ntTSL 58.36□□□□□ -1.074e-9■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 SRRM1-213ENST00000485441 561 ntTSL 35.2□□□□□ -1.586e-7■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 413.79□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 55.53□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 54.87□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 34.18□□□□□ -1.742e-6■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 34.05□□□□□ -1.762e-6■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 33.21□□□□□ -1.92e-6■■■■□ 20.1
SRSF7Q16629 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.171e-10■■■■□ 20
SRSF7Q16629 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.61e-10■■■■□ 20
SRSF7Q16629 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.841e-10■■■■□ 20
SRSF7Q16629 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.221e-10■■■■□ 20
SRSF7Q16629 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.771e-10■■■■□ 20
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