RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620026.1

TULP4-207, Transcript of tubby like protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene TULP4, Length 680 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4-207ENST00000620026 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.69■■■■■ 5.86
TULP4-207ENST00000620026 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.06■■■■■ 4.96
TULP4-207ENST00000620026 ABCC9O60706 1549 aa45.57■■■■■ 4.89
TULP4-207ENST00000620026 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.65■■■■■ 4.58
TULP4-207ENST00000620026 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.63■■■■■ 4.57
TULP4-207ENST00000620026 NACADO15069 1562 aa43.45■■■■■ 4.55
TULP4-207ENST00000620026 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.98■■■■■ 4.47
TULP4-207ENST00000620026 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.47
TULP4-207ENST00000620026 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.67■■■■■ 4.42
TULP4-207ENST00000620026 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.59■■■■■ 4.41
TULP4-207ENST00000620026 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.49■■■■■ 4.39
TULP4-207ENST00000620026 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.2■■■■■ 4.35
TULP4-207ENST00000620026 SCRIBQ14160 1630 aa42.12■■■■■ 4.33
TULP4-207ENST00000620026 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.1■■■■■ 4.33
TULP4-207ENST00000620026 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.76■■■■■ 4.28
TULP4-207ENST00000620026 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
TULP4-207ENST00000620026 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.13■■■■■ 4.17
TULP4-207ENST00000620026 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.97■■■■■ 4.15
TULP4-207ENST00000620026 SMARCA4P51532 1647 aa40.17■■■■■ 4.02
TULP4-207ENST00000620026 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
TULP4-207ENST00000620026 NCAPD3P42695 1498 aa40.08■■■■■ 4.01
TULP4-207ENST00000620026 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.07■■■■■ 4.01
TULP4-207ENST00000620026 SMARCA2P51531 1590 aa40.03■■■■■ 4
TULP4-207ENST00000620026 HMGXB3Q12766 1538 aa39.84■■■■□ 3.97
TULP4-207ENST00000620026 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.83■■■■□ 3.97
TULP4-207ENST00000620026 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
TULP4-207ENST00000620026 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.72■■■■□ 3.95
TULP4-207ENST00000620026 WIZO95785 1651 aa39.38■■■■□ 3.9
TULP4-207ENST00000620026 ERCC6Q03468 1493 aa39.38■■■■□ 3.9
TULP4-207ENST00000620026 NESP48681 1621 aa39.28■■■■□ 3.88
TULP4-207ENST00000620026 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
TULP4-207ENST00000620026 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.1■■■■□ 3.85
TULP4-207ENST00000620026 CUX2O14529 1486 aa38.98■■■■□ 3.83
TULP4-207ENST00000620026 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.95■■■■□ 3.83
TULP4-207ENST00000620026 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
TULP4-207ENST00000620026 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.94■■■■□ 3.82
TULP4-207ENST00000620026 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.76■■■■□ 3.8
TULP4-207ENST00000620026 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
TULP4-207ENST00000620026 CFTRP13569 1480 aa38.6■■■■□ 3.77
TULP4-207ENST00000620026 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.53■■■■□ 3.76
TULP4-207ENST00000620026 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.53■■■■□ 3.76
TULP4-207ENST00000620026 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.52■■■■□ 3.76
TULP4-207ENST00000620026 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.52■■■■□ 3.76
TULP4-207ENST00000620026 WDR62O43379 1518 aa38.33■■■■□ 3.73
TULP4-207ENST00000620026 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.25■■■■□ 3.71
TULP4-207ENST00000620026 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.22■■■■□ 3.71
TULP4-207ENST00000620026 PRDM2Q13029 1718 aa38.21■■■■□ 3.71
TULP4-207ENST00000620026 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
TULP4-207ENST00000620026 ABCC8Q09428 1581 aa37.84■■■■□ 3.65
TULP4-207ENST00000620026 TOPBP1Q92547 1522 aa37.83■■■■□ 3.65
TULP4-207ENST00000620026 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.75■■■■□ 3.63
TULP4-207ENST00000620026 IFT140Q96RY7 1462 aa37.71■■■■□ 3.63
TULP4-207ENST00000620026 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
TULP4-207ENST00000620026 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
TULP4-207ENST00000620026 OSCARQ8IYS5 282 aa37.41■■■■□ 3.58
TULP4-207ENST00000620026 SOGA1O94964 1423 aa37.4■■■■□ 3.58
TULP4-207ENST00000620026 CUX1P39880 1505 aa37.39■■■■□ 3.58
TULP4-207ENST00000620026 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
TULP4-207ENST00000620026 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.37■■■■□ 3.57
TULP4-207ENST00000620026 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.37■■■■□ 3.57
TULP4-207ENST00000620026 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
TULP4-207ENST00000620026 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.579e-8■■■■□ 22.8
TULP4-207ENST00000620026 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
TULP4-207ENST00000620026 FBLN2P98095 1184 aa37.14■■■■□ 3.54
TULP4-207ENST00000620026 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.09■■■■□ 3.53
TULP4-207ENST00000620026 WDR97A6NE52 1622 aa37.07■■■■□ 3.53
TULP4-207ENST00000620026 TRIM41Q8WV44 630 aa37.01■■■■□ 3.52
TULP4-207ENST00000620026 GRIN2BQ13224 1484 aa36.98■■■■□ 3.51
TULP4-207ENST00000620026 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.98■■■■□ 3.51
TULP4-207ENST00000620026 TOP2BQ02880 1626 aa36.96■■■■□ 3.51
TULP4-207ENST00000620026 CHD1O14646 1710 aa36.96■■■■□ 3.51
TULP4-207ENST00000620026 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.95■■■■□ 3.5
TULP4-207ENST00000620026 SYNJ1O43426 1573 aa36.94■■■■□ 3.5
TULP4-207ENST00000620026 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.94■■■■□ 3.5
TULP4-207ENST00000620026 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.93■■■■□ 3.5
TULP4-207ENST00000620026 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
TULP4-207ENST00000620026 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.5
TULP4-207ENST00000620026 PBRM1Q86U86 1689 aa36.8■■■■□ 3.48
TULP4-207ENST00000620026 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.79■■■■□ 3.48
TULP4-207ENST00000620026 SYNJ2O15056 1496 aa36.76■■■■□ 3.48
TULP4-207ENST00000620026 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.73■■■■□ 3.47
TULP4-207ENST00000620026 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.73■■■■□ 3.47
TULP4-207ENST00000620026 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.73■■■■□ 3.47
TULP4-207ENST00000620026 ARHGEF11O15085 1522 aa36.69■■■■□ 3.46
TULP4-207ENST00000620026 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.52■■■■□ 3.44
TULP4-207ENST00000620026 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.52■■■■□ 3.44
TULP4-207ENST00000620026 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.5■■■■□ 3.43
TULP4-207ENST00000620026 ADAMTS12P58397 1594 aa36.5■■■■□ 3.43
TULP4-207ENST00000620026 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.49■■■■□ 3.43
TULP4-207ENST00000620026 GRIN2AQ12879 1464 aa36.48■■■■□ 3.43
TULP4-207ENST00000620026 KIF27Q86VH2 1401 aa36.37■■■■□ 3.41
TULP4-207ENST00000620026 ARAP1Q96P48 1450 aa36.37■■■■□ 3.41
TULP4-207ENST00000620026 NUP160Q12769 1436 aa36.28■■■■□ 3.4
TULP4-207ENST00000620026 CEP170Q5SW79 1584 aa36.27■■■■□ 3.4
TULP4-207ENST00000620026 IGF1RP08069 1367 aa36.21■■■■□ 3.39
TULP4-207ENST00000620026 CUL7Q14999 1698 aa36.1■■■■□ 3.37
TULP4-207ENST00000620026 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.04■■■■□ 3.36
TULP4-207ENST00000620026 JPH4Q96JJ6 628 aa36.03■■■■□ 3.36
TULP4-207ENST00000620026 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.02■■■■□ 3.36
TULP4-207ENST00000620026 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms