Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDC37Q16543 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDC37Q16543 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDC37Q16543 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
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