Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF4Q15306 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF4Q15306 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF4Q15306 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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