Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMD6Q15008 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMD6Q15008 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMD6Q15008 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
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