Protein–RNA interactions for Protein: Q15005

SPCS2, Signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2Q15005 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPCS2Q15005 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPCS2Q15005 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPCS2Q15005 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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