Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 MKL2-207ENST00000573051 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 MKL2-205ENST00000572567 2185 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.982e-6■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.12e-6■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.192e-6■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.384e-7■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 311.61□□□□□ -0.554e-7■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 310.38□□□□□ -0.754e-7■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 DUXAP10-210ENST00000624585 4667 ntTSL 217.26■□□□□ 0.352e-8■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 DUXAP10-202ENST00000549065 575 ntTSL 413.75□□□□□ -0.212e-8■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 DUXAP10-207ENST00000616922 642 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.652e-8■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.082e-6■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.082e-6■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 HM13-219ENST00000487964 902 ntTSL 516.09■□□□□ 0.174e-6■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 HM13-208ENST00000464508 855 ntTSL 214.71□□□□□ -0.054e-6■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 HM13-216ENST00000479096 598 ntTSL 311.96□□□□□ -0.494e-6■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 HM13-209ENST00000464661 906 ntTSL 311.62□□□□□ -0.554e-6■■■□□ 18.9
HLTFQ14527 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-7■■■□□ 18.8
HLTFQ14527 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.948e-16■■■□□ 18.8
HLTFQ14527 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.638e-16■■■□□ 18.8
HLTFQ14527 MLLT10-215ENST00000495130 744 ntTSL 312.29□□□□□ -0.448e-16■■■□□ 18.8
HLTFQ14527 MLLT10-211ENST00000471315 319 ntTSL 311.79□□□□□ -0.528e-16■■■□□ 18.8
HLTFQ14527 MAPK8IP3-212ENST00000567849 551 ntTSL 55.16□□□□□ -1.582e-6■■■□□ 18.8
HLTFQ14527 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.651e-6■■■□□ 18.8
HLTFQ14527 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.351e-6■■■□□ 18.8
HLTFQ14527 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.126e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 FOXN3-208ENST00000555034 505 ntTSL 37.71□□□□□ -1.185e-8■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 FOXN3-205ENST00000553904 337 ntTSL 36.5□□□□□ -1.375e-8■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.445e-6■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 SLC12A4-205ENST00000570616 406 ntTSL 322.55■■□□□ 1.25e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.095e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.925e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 SLC12A4-203ENST00000537830 3525 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.355e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 SLC12A4-204ENST00000541864 3627 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.355e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 SLC12A4-209ENST00000572037 3620 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.365e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 SLC12A4-219ENST00000576616 3768 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.445e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 SLC12A4-206ENST00000570802 3761 ntTSL 212.06□□□□□ -0.485e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.085e-6■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.41e-10■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 216.25■□□□□ 0.191e-10■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-6■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 ZFAND3-202ENST00000373389 531 ntTSL 510.99□□□□□ -0.652e-6■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 57.01□□□□□ -1.292e-6■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.676e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.126e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.561e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.371e-7■■■□□ 18.7
HLTFQ14527 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.452e-6■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.335e-9■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 ESYT2-202ENST00000275418 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.6■■□□□ 1.215e-9■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.695e-9■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 ESYT2-204ENST00000483958 546 ntTSL 47.77□□□□□ -1.175e-9■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 319.75■□□□□ 0.751e-6■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 419.75■□□□□ 0.751e-6■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 417.97■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 313.27□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 GMDS-AS1-214ENST00000534468 724 ntTSL 311.95□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-6■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.083e-6■■■□□ 18.6
HLTFQ14527 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.911e-6■■■□□ 18.5
HLTFQ14527 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.691e-6■■■□□ 18.5
HLTFQ14527 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.043e-6■■■□□ 18.5
HLTFQ14527 ACSM3-203ENST00000501740 839 ntTSL 514.13□□□□□ -0.158e-7■■■□□ 18.5
HLTFQ14527 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 412.18□□□□□ -0.468e-7■■■□□ 18.5
HLTFQ14527 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 411.74□□□□□ -0.538e-7■■■□□ 18.5
HLTFQ14527 L3MBTL4-203ENST00000400105 3546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.861e-6■■■□□ 18.5
HLTFQ14527 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.892e-7■■■□□ 18.5
HLTFQ14527 IQGAP2-217ENST00000514350 2617 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-7■■■□□ 18.5
HLTFQ14527 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.612e-6■■■□□ 18.5
HLTFQ14527 DUXAP10-206ENST00000614614 712 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.584e-8■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 DUXAP10-209ENST00000619784 903 ntTSL 310.81□□□□□ -0.684e-8■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 DUXAP10-205ENST00000612696 4119 ntTSL 1 (best)9.34□□□□□ -0.914e-8■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 RB1CC1-208ENST00000521611 528 ntTSL 522.68■■□□□ 1.229e-7■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.539e-7■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.469e-7■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-6■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.487e-7■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.017e-7■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.667e-7■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 MAP4-214ENST00000482752 386 ntTSL 33.31□□□□□ -1.887e-7■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.372e-6■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 PAXBP1-204ENST00000443785 2920 ntTSL 1 (best)20.92■□□□□ 0.942e-6■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 STARD9-203ENST00000562619 7237 ntTSL 1 (best)9.87□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 18.4
HLTFQ14527 PAN3-204ENST00000503791 2443 ntTSL 225.96■■□□□ 1.753e-6■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.083e-6■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.143e-6■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 AFTPH-207ENST00000498706 4674 ntTSL 1 (best)6.59□□□□□ -1.352e-6■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.522e-6■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.42□□□□□ -1.547e-9■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.623e-6■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.015e-7■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.211e-8■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-8■■■□□ 18.3
HLTFQ14527 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.031e-8■■■□□ 18.3
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