Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SCARF1Q14162 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCARF1Q14162 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARF1Q14162 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCARF1Q14162 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
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