Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRF5Q13568 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IRF5Q13568 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRF5Q13568 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
IRF5Q13568 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IRF5Q13568 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.57■■■□□ 2
IRF5Q13568 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IRF5Q13568 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRF5Q13568 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IRF5Q13568 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IRF5Q13568 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IRF5Q13568 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
IRF5Q13568 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IRF5Q13568 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRF5Q13568 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
IRF5Q13568 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IRF5Q13568 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IRF5Q13568 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRF5Q13568 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRF5Q13568 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IRF5Q13568 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IRF5Q13568 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IRF5Q13568 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRF5Q13568 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IRF5Q13568 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRF5Q13568 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRF5Q13568 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
IRF5Q13568 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IRF5Q13568 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
IRF5Q13568 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IRF5Q13568 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IRF5Q13568 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IRF5Q13568 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF5Q13568 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
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