Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTA1Q13424 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTA1Q13424 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTA1Q13424 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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