Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRPL49Q13405 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRPL49Q13405 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL49Q13405 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL49Q13405 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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