Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1H3Q13133 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR1H3Q13133 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NR1H3Q13133 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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