Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPS1Q13098 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPS1Q13098 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPS1Q13098 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPS1Q13098 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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