Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCB1Q12824 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCB1Q12824 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCB1Q12824 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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