Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CGNL1Q0VF96 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CGNL1Q0VF96 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CGNL1Q0VF96 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CGNL1Q0VF96 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms