Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PDE4CQ08493 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE4CQ08493 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE4CQ08493 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms