Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBXN1Q04323 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBXN1Q04323 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBXN1Q04323 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms