Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TGFBR3Q03167 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TGFBR3Q03167 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms