Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PMP22Q01453 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PMP22Q01453 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMP22Q01453 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms