Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDC42EP1Q00587 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC42EP1Q00587 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC42EP1Q00587 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP1Q00587 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms