Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAT1AQ00266 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAT1AQ00266 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAT1AQ00266 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAT1AQ00266 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms