Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAP25P60880 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNAP25P60880 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms