Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCBP3P57721 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCBP3P57721 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCBP3P57721 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms