Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA4P54764 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHA4P54764 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHA4P54764 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms