Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KPNA1P52294 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KPNA1P52294 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KPNA1P52294 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KPNA1P52294 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms