Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ASCL1P50553 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL1P50553 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL1P50553 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL1P50553 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASCL1P50553 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL1P50553 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASCL1P50553 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ASCL1P50553 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ASCL1P50553 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ASCL1P50553 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL1P50553 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL1P50553 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL1P50553 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASCL1P50553 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL1P50553 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL1P50553 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL1P50553 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL1P50553 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL1P50553 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL1P50553 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL1P50553 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL1P50553 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ASCL1P50553 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL1P50553 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL1P50553 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL1P50553 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL1P50553 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL1P50553 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL1P50553 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL1P50553 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ASCL1P50553 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ASCL1P50553 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ASCL1P50553 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL1P50553 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL1P50553 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL1P50553 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL1P50553 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL1P50553 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL1P50553 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL1P50553 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms