Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYB561P49447 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYB561P49447 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYB561P49447 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYB561P49447 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYB561P49447 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYB561P49447 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYB561P49447 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYB561P49447 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYB561P49447 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYB561P49447 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYB561P49447 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYB561P49447 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYB561P49447 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYB561P49447 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYB561P49447 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYB561P49447 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYB561P49447 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYB561P49447 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561P49447 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561P49447 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561P49447 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561P49447 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561P49447 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561P49447 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561P49447 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561P49447 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561P49447 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYB561P49447 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYB561P49447 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYB561P49447 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYB561P49447 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYB561P49447 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYB561P49447 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYB561P49447 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYB561P49447 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYB561P49447 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYB561P49447 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYB561P49447 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYB561P49447 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYB561P49447 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYB561P49447 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYB561P49447 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYB561P49447 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYB561P49447 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYB561P49447 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYB561P49447 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYB561P49447 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYB561P49447 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYB561P49447 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYB561P49447 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYB561P49447 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYB561P49447 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYB561P49447 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CYB561P49447 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYB561P49447 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYB561P49447 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYB561P49447 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYB561P49447 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561P49447 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561P49447 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561P49447 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561P49447 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561P49447 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561P49447 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561P49447 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561P49447 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561P49447 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561P49447 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYB561P49447 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561P49447 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561P49447 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561P49447 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561P49447 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561P49447 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561P49447 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561P49447 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561P49447 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561P49447 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561P49447 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYB561P49447 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYB561P49447 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYB561P49447 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYB561P49447 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYB561P49447 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYB561P49447 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYB561P49447 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYB561P49447 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYB561P49447 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYB561P49447 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYB561P49447 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYB561P49447 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYB561P49447 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYB561P49447 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYB561P49447 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYB561P49447 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYB561P49447 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561P49447 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561P49447 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYB561P49447 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms