Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
HCAR3P49019 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HCAR3P49019 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HCAR3P49019 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HCAR3P49019 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCAR3P49019 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCAR3P49019 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCAR3P49019 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HCAR3P49019 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms