Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSSP48449 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LSSP48449 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSSP48449 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LSSP48449 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSSP48449 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSSP48449 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSSP48449 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSSP48449 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSSP48449 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSSP48449 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSSP48449 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSSP48449 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSSP48449 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSSP48449 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSSP48449 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSSP48449 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSSP48449 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSSP48449 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSSP48449 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSSP48449 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSSP48449 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSSP48449 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSSP48449 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSSP48449 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSSP48449 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSSP48449 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSSP48449 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSSP48449 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSSP48449 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSSP48449 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSSP48449 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSSP48449 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSSP48449 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSSP48449 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSSP48449 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSSP48449 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSSP48449 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSSP48449 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSSP48449 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSSP48449 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSSP48449 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSSP48449 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSSP48449 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSSP48449 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSSP48449 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSSP48449 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSSP48449 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSSP48449 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSSP48449 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSSP48449 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSSP48449 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSSP48449 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LSSP48449 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSSP48449 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSSP48449 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSSP48449 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSSP48449 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSSP48449 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSSP48449 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSSP48449 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSSP48449 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSSP48449 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSSP48449 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LSSP48449 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSSP48449 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSSP48449 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSSP48449 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSSP48449 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSSP48449 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSSP48449 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSSP48449 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LSSP48449 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LSSP48449 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LSSP48449 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSSP48449 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSSP48449 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSSP48449 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSSP48449 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSSP48449 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LSSP48449 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSSP48449 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSSP48449 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSSP48449 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSSP48449 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSSP48449 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSSP48449 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms