Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RXRGP48443 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RXRGP48443 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RXRGP48443 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RXRGP48443 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RXRGP48443 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RXRGP48443 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RXRGP48443 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RXRGP48443 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RXRGP48443 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RXRGP48443 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RXRGP48443 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RXRGP48443 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RXRGP48443 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RXRGP48443 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RXRGP48443 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RXRGP48443 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXRGP48443 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXRGP48443 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXRGP48443 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXRGP48443 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXRGP48443 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXRGP48443 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RXRGP48443 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXRGP48443 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXRGP48443 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXRGP48443 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RXRGP48443 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RXRGP48443 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RXRGP48443 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXRGP48443 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXRGP48443 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXRGP48443 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXRGP48443 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXRGP48443 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXRGP48443 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXRGP48443 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RXRGP48443 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXRGP48443 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXRGP48443 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RXRGP48443 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RXRGP48443 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RXRGP48443 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RXRGP48443 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXRGP48443 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXRGP48443 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXRGP48443 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXRGP48443 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXRGP48443 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXRGP48443 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXRGP48443 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXRGP48443 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXRGP48443 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXRGP48443 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXRGP48443 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RXRGP48443 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RXRGP48443 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RXRGP48443 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RXRGP48443 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RXRGP48443 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RXRGP48443 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RXRGP48443 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RXRGP48443 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXRGP48443 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXRGP48443 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RXRGP48443 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXRGP48443 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXRGP48443 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXRGP48443 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXRGP48443 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXRGP48443 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXRGP48443 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXRGP48443 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RXRGP48443 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RXRGP48443 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RXRGP48443 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RXRGP48443 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RXRGP48443 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RXRGP48443 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RXRGP48443 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RXRGP48443 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RXRGP48443 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RXRGP48443 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RXRGP48443 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXRGP48443 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXRGP48443 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXRGP48443 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXRGP48443 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RXRGP48443 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RXRGP48443 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXRGP48443 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms